home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00139 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  51 lines
  1. **************************************
  2. * E1-E2 ATPases phosphorylation site *
  3. **************************************
  4.  
  5. E1-E2 ATPases are cation transport  ATPases which  form  an aspartyl phosphate
  6. intermediate in  the  course  of  ATP hydrolysis. ATPases which belong to this
  7. family are listed below [1,2,3].
  8.  
  9.  - Fungal and plant plasma membrane (H+) ATPases [reviewed in 3].
  10.  - Vertebrate (Na+, K+) ATPases (sodium pump) [reviewed in 5,6].
  11.  - Gastric (K+, H+) ATPases (proton pump).
  12.  - Calcium (Ca++) ATPases (calcium pump) from the sarcoplasmic reticulum (SR),
  13.    the endoplasmic reticulum (ER) and the plasma membrane.
  14.  - Copper (Cu++) ATPases (copper pump) which are involved in two human genetic
  15.    disorders: Menkes syndrome and Wilson disease [7].
  16.  - Bacterial potassium (K+) ATPases.
  17.  - Bacterial cadmium efflux (Cd++) ATPases [reviewed in 8].
  18.  - Bacterial magnesium (Mg++) ATPases [9].
  19.  - A probable cation ATPase from Leishmania.
  20.  - fixI,  a  probable  cation  ATPase    from  Rhizobium meliloti, involved in
  21.    nitrogen fixation.
  22.  
  23. The region  around the phosphorylated aspartate residue is perfectly conserved
  24. in all these ATPases and can be used as a signature pattern.
  25.  
  26. -Consensus pattern: D-K-T-G-T-[LIVM]-[TI]
  27.                     [D is phosphorylated]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Staphylococcus  aureus  DNA  gyrase
  30.  subunit B.
  31. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  32.  
  33. [ 1] Green N.M., McLennan D.H.
  34.      Biochem. Soc. Trans. 17:819-822(1989).
  35. [ 2] Green N.M.
  36.      Biochem. Soc. Trans. 17:970-972(1989).
  37. [ 3] Fagan M.j., Saier M.H. Jr.
  38.      J. Mol. Evol. 38:57-99(1994).
  39. [ 4] Serrano R.
  40.      Biochim. Biophys. Acta 947:1-28(1988).
  41. [ 5] Fambrough D.M.
  42.      Trends Neurosci. 11:325-328(1988).
  43. [ 6] Sweadner K.J.
  44.      Biochim. Biophys. Acta 988:185-220(1989).
  45. [ 7] Bull P.C., Thomas G.R., Rommens J.M., Forbes J.R., Cox D.
  46.      Nature Genet. 5:327-337(1993).
  47. [ 8] Silver S., Nucifora G., Chu L., Misra T.K.
  48.      Trends Biochem. Sci. 14:76-80(1989).
  49. [ 9] Snavely M.D., Miller C.G., Maguire M.E.
  50.      J. Biol. Chem. 266:815-823(1991).
  51.